針對(duì)填料保留機(jī)理的不同（填料保留目標(biāo)化合物或保留雜質(zhì)），操作稍有不同。
目標(biāo)化合物保留模式
固相萃取操作一般有四步：
①活化----除去小柱內(nèi)的雜質(zhì)并創(chuàng)造一定的溶劑環(huán)境。
②上樣----將樣品用一定的溶劑溶解，轉(zhuǎn)移入柱并使組分保留在柱上。
③淋洗----最大程度除去干擾物。
④洗脫----用小體積的溶劑將被測(cè)物質(zhì)洗脫下來(lái)并收集。（注意流速不要過(guò)快）
雜質(zhì)保留模式
固相萃取操作一般有三步：
①活化----除去柱子內(nèi)的雜質(zhì)并創(chuàng)造一定的溶劑環(huán)境。
②上樣----將樣品轉(zhuǎn)移入柱，此時(shí)大部分目標(biāo)化合物會(huì)隨樣品基液流出，雜質(zhì)被保留在柱上，故此步驟要開(kāi)始收集。
③洗脫----用小體積的溶劑將組分淋洗下來(lái)并收集，合并收集液。（注意流速不要過(guò)快）
 
不可忽視傳統(tǒng)的液體萃取
　　有些人在初次接觸固相萃取時(shí)，總覺(jué)得它能取代液體萃取，實(shí)際上就象毛細(xì)管電泳無(wú)法取代液相色譜一樣。固相萃取在某些場(chǎng)合比液體萃取合適，但是在更多情況下，還是傳統(tǒng)的液體萃取更可靠更合適。這一點(diǎn)從目前實(shí)驗(yàn)技術(shù)的實(shí)際發(fā)展可以得到印證。
　　關(guān)于液固萃取，我們不要僅僅把它看作是一個(gè)提取過(guò)程，從另一個(gè)角度來(lái)看，它還是一個(gè)凈化過(guò)程，是把固形干擾物排除凈化的過(guò)程。理解這一點(diǎn)，有助于我們優(yōu)化選擇實(shí)驗(yàn)方法。
一般被柱中吸附劑吸附的被測(cè)物及干擾物的總質(zhì)量不應(yīng)超過(guò)吸附物總質(zhì)量的5%。洗脫劑的體積一般應(yīng)是萃取柱柱床體積的2-5倍。